（按時間順序排列）

    1月6日，中央國家機關(guān)工委決定（國機精〔2009〕2號文件），授予國家中醫(yī)藥管理局醫(yī)政司為中央國家機關(guān)“創(chuàng)建文明機關(guān) 爭做人民滿意公務(wù)員”活動先進單位；授予國家中醫(yī)藥管理局國際合作司亞美多邊處處長朱海東同志、科技司中醫(yī)科技處副主任科員陳麗娜同志為中央國家機關(guān)“創(chuàng)建文明機關(guān) 爭做人民滿意公務(wù)員”活動先進個人，并予以通報表彰。
    1月23日，中央精神文明建設(shè)指導(dǎo)委員會決定，授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院“全國文明單位”稱號。
    3月25日，中央國家機關(guān)7部門（精神文明、綜合治理、綠化、計劃生育、愛國衛(wèi)生、交通安全、環(huán)境整治）決定（國機精〔2009〕2號文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院“中央國家機關(guān)文明單位標兵”稱號；授予國家中醫(yī)藥管理局機關(guān)服務(wù)中心、中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院、望京醫(yī)院、眼科醫(yī)院“中央國家機關(guān)文明單位”稱號；授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院閆桐同志“中央國家機關(guān)‘平安奧運行動’先進工作者”稱號。
    4月20日，中央國家機關(guān)工會聯(lián)合會決定，表彰國家中醫(yī)藥管理局中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院先進集體，頒發(fā)中央國家機關(guān)五一勞動獎狀；表彰國家中醫(yī)藥管理局黨組成員、辦公室主任王志勇同志、國家中醫(yī)藥管理局中國中醫(yī)科學(xué)院眼科醫(yī)院名譽院長唐由之同志先進個人，頒發(fā)中央國家機關(guān)五一勞動獎?wù)隆?br />    6月18日，首都精神文明建設(shè)委員會決定（精建〔2009〕9號文件），授予中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院“2008年度首都文明單位標兵”稱號；授予中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院、望京醫(yī)院、眼科醫(yī)院“2008年度首都文明單位”稱號。
    7月2日，中央國家機關(guān)工會聯(lián)合會決定（國機工辦〔2009〕151號文件），授予國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)工會2008年財務(wù)工作優(yōu)秀獎。
    11月3日，首都精神文明建設(shè)委員會決定，國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)黨委獲“首都‘迎國慶講文明樹新風(fēng)’活動先進單位”稱號；國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)團委副書記劉燦、機關(guān)工會工作人員孟繁琪同志獲“首都‘迎國慶講文明樹新風(fēng)’活動先進個人”稱號。
    11月6日，中央國家機關(guān)黨工委組織部、中央國家機關(guān)團工委決定，授予國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)黨委國慶60周年群眾游行活動“突出貢獻單位”稱號；授予國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)團委國慶60周年群眾游行活動“優(yōu)秀組織單位”稱號；授予國家中醫(yī)藥管理局（中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院）李丁同志國慶60周年群眾游行“優(yōu)秀隊員”稱號。
    11月12日，中央國家機關(guān)黨工委組織部通報，國家中醫(yī)藥管理局2008年度黨內(nèi)統(tǒng)計報表被評為中央國家機關(guān)2008年度全優(yōu)報表。
    12月4日，中央國家機關(guān)團工委決定（國團工組〔2009〕72號文件），授予國家中醫(yī)藥管理局直屬機關(guān)團委“根在基層”調(diào)研實踐活動優(yōu)秀組織獎。
    12月18日，國家中醫(yī)藥管理局乒乓球代表隊獲“中國移動激情100”乒乓球賽北京賽區(qū)團體冠軍。
    12月20日，北京市公安局授予中國中醫(yī)科學(xué)院“集體三等功”，授予國家中醫(yī)藥管理局辦公室副主任蔣健、國家中醫(yī)藥管理局辦公室綜合處處長陳偉、國家中醫(yī)藥管理局社會治安綜合治理辦公室主任楊銳等3名同志“個人三等功”，授予國家中醫(yī)藥管理局機關(guān)服務(wù)中心趙麗蓉、周建民、中國中醫(yī)科學(xué)院眼科醫(yī)院張進洲、中國中醫(yī)科學(xué)院信息研究所侯陽等4名同志“個人嘉獎”。